Научно-исследовательская работа, проводимая на кафедре биохимии, направлена на изучение актуальных проблем современной медицинской науки, разработку инновационных подходов и внедрение их в образование и практику. Исследования тесно связаны с реальными потребностями здравоохранения, приоритетными направлениями, определёнными в государственных программах развития науки и техники, и охватывают такие вопросы, как: охрана здоровья матери и ребёнка, разработка методов ранней диагностики, лечения и профилактики заболеваний с учётом региональных особенностей, применение современных интерактивных методов в высшем медицинском образовании, создание виртуальных лабораторий и внедрение их в учебный процесс.
Одновременно деятельность кафедры направлена на воспитание молодого поколения в духе преданности идеям независимости, формирование у них правового сознания и духовного мировоззрения. Студенты активно привлекаются к научным исследованиям, у них формируются профессиональная компетентность, навыки самостоятельного мышления и гражданская позиция. Научно-исследовательская работа кафедры, объединяя образование, науку и практику, служит подготовке высококвалифицированных, патриотичных и современных специалистов.
Кафедра осуществляет свою научную деятельность на основании меморандумов о сотрудничестве с Южно-Казахстанской медицинской академией, Научно-исследовательским институтом паразитологии.
За последние 4 года, по результатам выполненных научно-исследовательских работ, сотрудниками кафедры были защищены следующие кандидатские диссертации:
Файзуллаева Х.Б. — «Прогностическая информативность клинико-лабораторных показателей у новорождённых, родившихся с асфиксией».

Саттарова Х.Г. — «Совершенствование серологической диагностики эхинококкоза».
Мамадалиева З.Р. — «Совершенствование методики преподавания биохимии в медицинских вузах с использованием виртуальных лабораторий».


Усаров Г.Х. «Фауна москитов (Diptera: Phlebotominae) Центрального и Южного Узбекистана и их эпидемиологическое значение».

Все сотрудники кафедры активно участвуют в научно-исследовательской работе кафедры и университета. В настоящее время 8 сотрудников являются самостоятельными исследователями (Саидмуродова З.А., Халимова С.А., Толипова Ш.Э., Назарова М.Э., Кельдиярова Ш.Х., Муртазаева Н.К., Ким О.В., Назарова Г.Ш.), а один сотрудник (Ахмедов А.С.) одновременно обучается в докторантуре.
За последние 5 лет сотрудниками кафедры опубликовано более 200 научных работ, в том числе 3 учебника, 7 учебных пособия, 8 монографии, 9 электронных программ, а также более 100 статей в ведущих республиканских и международных журналах.