Факультет педиатрии Самаркандского государственного медицинского университета был основан в 1963 году. Первым деканом факультета был доцент Камалов Н.М. В первые годы организации студенты педиатрического факультета обучались на кафедрах лечебного факультета. Позже в программе подготовки педиатрических специалистов были созданы самостоятельные кафедры педиатрии. В 1966 году - кафедра пропедевтики детских болезней, в 1967 году - кафедра педиатрии, в 1968 году - кафедра госпитальной педиатрии, в 1970 году - кафедра детской хирургии, в 1972 году - курс акушерства и гинекологии которая в 1974 году – была преобразована в кафедру, в 1973 году создана кафедра терапии педиатрического факультета. В 1985 году была создана кафедра госпитальной детской хирургии с курсом анестезиологии и реаниматологии, а позднее кафедры неонатологии и неотложной педиатрии.
Со дня создания факультета на должности декана работали, доцент Н.М.Камалов, профессор П.М.Лернер, профессор С.Х.Абдуллаев, доцент Р.М.Салохитдинова, доцент Г.У.Шараджабов, профессор С.А.Борухов, профессор Х.М.Маматкулов, профессор Р.Д.Джабборов, доктор медицинских наук А.У.Рахимов, доцент А.А.Абдусаламов, доцент Ш.Х.Мавлянов, доктор медицинских наук, доцент Э.Э.Кобилов, профессор Н.М.Шавази, в настоящее время деканом педиатрического факультета является доцент С.А. Карабаев.
За прошедший период факультет подготовил 12 тысяч врачей-педиатров, которые самоотверженно трудятся на благо охраны здоровья подрастающего поколения не только в Узбекистане, но и во многих других странах. Среди выпускников факультета много организаторов здравоохранения: руководители областных управлений здравоохранения, заместители руководителей, главные врачи областных и городских медицинских центров, медицинских объединений. Более 50 выпускников защитили докторские диссертации и работают в различных высших учебных заведениях и исследовательских институтах.
В настоящее время в составе Педиатрического факультета работают 16 кафедр. Это кафедры: педиатрии №1 и неонатологии, педиатрии №2, педиатрии № 3 и медицинской генетики, детской хирургии №1, детской хирургии №2, неврологии, нейрохирургии, офтальмологии, акушерства и гинекологии №2, травматологии и ортопедии, лучевой диагностики и терапии, пропедевтики детских болезней, хирургических болезней, клинической и лабораторной диагностики, внутренних болезней педиатрического факультета, инфекционных болезней и эпидемиологии.
Из 188 профессоров, работающих на факультете, 97 (51,87%) имеют ученые степени, в том числе 25 (13%) докторов наук, 54 (29%) кандидатов наук.
Среди выпускников факультета есть такие наставники и опытные специалисты своего дела как - профессор И.А.Ахмеджанов, профессор Б.Б.Негматджанов, профессор Н.М.Шавази, профессор А.Т.Джурабекова, профессор С.К.Абдурахманова, профессор Т.А.Бобомуратов, доктор медицинских наук М.Н.Абдуллаева, доктор медицинских наук Л.А.Мухаммадиева, доктор медицинских наук Д.Т.Раббимова, профессор Д.О.Атакулов, профессор Ю.М.Ахмедов, доцент Ф.Ш.Мавлянов которые по сей день вносят свой бесценный вклад в воспитании молодого поколения.
На сегодняшний день на факультете обучаются 1831 студентов. Обучение ведётся на узбекском, русском и английском языках в соответствии с требованиями квалификации врача-педиатра по направлению 5510200 – «педиатрическое дело».
В целях поддержки образованной и амбициозной молодёжи, среди студентов ежегодно проводятся конкурсы на ректорскую стипендию и на другие государственные стипендии.
В настоящее время на факультете заместителем декана по работе с молодёжью является А.Р.Эргашев, заместитель декана по учебной работе М.Н.Нуритдинов, а так же М.М.Юсупов, Т.Ш.Шокиров, Г.А.Якубов и О.С.Нурматов работают с молодёжью, следят за повседневной жизнью студентов, учебными процессами и дают необходимые советы. На факультете общая численность студентов за каждый семестр должна быть не менее 99,5-99,8%, качественный уровень усвоения предметов должен составлять 80-90%, что сопровождается постоянным совершенствованием знаний и навыков студентов.
На педиатрическом факультете в разное время на должности заместителя декана работали: профессор Ф.К.Ханнанова, профессор С.А.Борухов, профессор М.А.Ахмедов, профессор А.Э.Маматов, профессор М.К.Азизов, доцент М.Т.Насекин, доцент А.М.Расулов, профессор В.Р.Лемелев, доцент Ш.К.Дехканов, доцент Ш.Х.Мавлянов, к.м.н. Ж.Т.Туракулов, доцент А.Ю.Язданов, доцент У.Х.Шодиев, кандидат медицинских наук, доцент К.Т.Советов, доцент С.Ж.Юлдашев, доцент К.М.Халиков, доцент А.Х.Джалилов, доцент Х.А.Тиляков, ассистент А.Р.Усанов, ассистент Р.Х.Холиев, доцент Б.А.Джуманов, ассистент А.А.Самадов, ассистент А.Н.Нармурадов.
Научная работа, проводимая учёными факультета, всегда неразрывно связана с подготовкой научно-педагогических кадров и потребностями практического здравоохранения.
Следует отметить, что учёные факультета участвуют в конкурсах на получение грантов по выполнению своих научных исследований. Примерами являются такие кафедры как, кафедра детской хирургии №1, кафедра нейрохирургии и кафедра хирургических болезней.
По результатам научных исследований, выполненных в 2022-2023 годах, защищено 4 докторских и 15 кандидатских диссертаций, опубликовано 826 научных работ, в том числе 331 в республиканских журналах, 269 зарубежом, 41 монографий, 42 научных статей, 108 учебно-методических работ. разработаны методические рекомендации, 18 статей в журналах Scopus и WoS, 17 учебников.
Большое внимание уделяется работе с одарёнными студентами, в 2023 году в группу одарённых учащихся принято более 150 студентов, которые активно участвуют в работе студенческих научных кружков, представляют университет на республиканских олимпиадах, участвуют с докладами на университетских, республиканских и международных научных конференциях.
