Научно-исследовательская работа в СамГМУ направлена на реализацию мероприятий государственной политики в сфере здравоохранения и включает мероприятия по разработке инновационной продукции, критически важных технологий и компетенций.

Основные направления научной деятельности СамГМУ:

• Разработка передовых технологий профилактики, диагностики и лечения социально-значимых заболеваний человека инфекционной и неинфекционной этиологии;
• Разработка новых технологий в области укрепления репродуктивного здоровья населения, охраны здоровья матерей, детей и подростков;
• Создание и внедрение современных технологий профилактики, диагностики и лечения травм, хирургических болезней и опухолей;
• Разработка и внедрение в практику новых лекарственных препаратов, инновационных медицинских биотехнологий;
• Психология инновационного поведения: становление инновационной личности. Социально-гуманитарные проблемы современного общества.