ПБиМ 2023 №3,1 (145)
Subject of the article
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ТЕХНОЛОГИЯ ИМПЕДАНСНЫХ ДНК-НАНОСЕНСОРОВ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ВАРИАБЕЛЬНЫХ ГЕНОМОВ РНК-СОДЕРЖАЩИХ ВИРУСОВ: ОПЫТ ДИАГНОСТИКИ ВИРУСА ГЕПАТИТА Е (52-55)
Authors
Бабенко Андрей Сергеевич1, Грушевская Галина Владиславовна2, Крылова Нина Георгиевна2, Липневич Игорь Владимирович2, Чакуков Руслан Фатихович3, Давыдов Владимир Витольдович1, Задора Илона Сергеевна1, Марчук Светлана Ивановна1, Борисовец Дмитрий Сергеевич4, Карпуть Ирина Александровна5, Филонюк Василий Алексеевич1, Жаворонок Сергей Владимирович1
Institution
1 - Белорусский государственный медицинский университет, Минск, Беларусь; 2 - Белорусский государственный университет, Минск, Беларусь; 3 - ООО «Умные ДНК Технологии», Минск, Беларусь; 4 - Институт экспериментальной ветеринарии им. С.Н. Вышелесского НАН Беларуси, Минск, Беларусь; 5 - Гродненский государственный медицинский университет, Гродно, Беларусь
Abstract
Гепатит Е вируси геноми жуда ўзгарувчан. Кенгайтирилган консервацияланган ҳудудларнинг йўқлиги ушбу вируснинг ПЗР диагностикасини мураккаблаштиради. Мақсад: импеданс ДНК наносенсорлари технологияси асосида гепатит Е вируси РНКсини аниқлаш тизимини ишлаб чиқиш ва оптималлаштириш, шунингдек, таҳлил натижаларини сертификатланган диагностик реактивлар тўпламлари ёрдамида олинган натижалар билан солиштириш. Тадқиқот Минскдаги (Беларус) юқумли касалликлар шифохоналарида даволанаётган беморларнинг шаффоф нажас массаларининг клиник намуналаридан фойдаланилган. Маълумот сифатида HEV RT-PCR Kit 2.0 реактив тўплами (RealStar®, Altona Diagnostics GmbH, Германия) ишлатилган. Вирус РНКни таниб олиш учун Ugene v. 35.0 (Unipro, РФ) дастури ёрдамида қўлланилган. Ушбу иш натижасида биз томонидан ишлаб чиқилган таҳлил протоколи билан импеданс ДНК наносенсорлари технологияси гепатит Е вируси РНК клиник диагностикасида қўлланилиши мумкинлигини аниқладик. Олинган маълумотлар сертификатланган маълумотнома усулига тўлиқ мос келади.
Key words
ДНК наносенсор, гепатит Е вируси, реал вақтда ПЗР, клиник диагностика.
Literature
1. Lin S, Yang L, Zhang YJ. Hepatitis E Virus: Isolation, Propagation, and Quantification. Curr Protoc. 2023 Jan;3(1):e642. 2. Alzate D, Lopez-Osorio MC, Cortés-Mancera F, Navas MC, Orozco J. Detection of hepatitis E virus genotype 3 in wastewater by an electrochemical genosensor. Anal Chim Acta. 2022 Aug 15;1221:340121. 3. Irshad M, Gupta P, Mankotia DS, Ansari MA. Multiplex qPCR for serodetection and serotyping of hepatitis viruses: A brief review. World J Gastroenterol. 2016 May 28;22(20):4824-34. 4. Martin-Latil S, Hennechart-Collette C, Delannoy S, Guillier L, Fach P, Perelle S. Quantification of Hepatitis E Virus in Naturally-Contaminated Pig Liver Products. Front Microbiol. 2016 Aug 3;7:1183. 5. Kar P, Karna R. A Review of the Diagnosis and Management of Hepatitis E. Curr Treat Options Infect Dis. 2020;12(3):310-320. 6. Новая тест-система для выявления РНК вируса гепатита Е методом ПЦР в режиме реального времени / В. В. Давыдов, А. С. Бабенко, С. В. Жаворонок [и др.] // Лабораторная диагностика. Восточная Европа. – 2021. – Т. 10, № 3. – С. 346-359. 7. Wang Y, Toh X, Ong J, Teo XH, Bay P, Fernandez CJ, Huangfu T. Serological prevalence and molecular characterization of hepatitis E virus in imported pigs in Singapore (2000-2019). Transbound Emerg Dis. 2022 Mar;69(2):286-296. 8. Saylan Y, Denizli A. Molecularly Imprinted Polymer-Based Microfluidic Systems for Point-of-Care Applications. Micromachines (Basel). 2019 Nov 11;10(11):766. 9. Ganganboina AB, Khoris IM, Chowdhury AD, Li TC, Park EY. Ultrasensitive Detection of the Hepatitis E Virus by Electrocatalytic Water Oxidation Using Pt-Co3O4 Hollow Cages. ACS Appl Mater Interfaces. 2020 Nov 11;12(45):50212-50221. 10. Nanopore–Penetration Sensing Effects for Target DNA Sequencing via Impedance Difference Between Organometallic–Complex–Decorated Carbon Nanotubes with Twisted Single–Stranded or Double–Stranded DNA Babenko, A.S., Grushevskaya, H.V., Krylova, N.G., Egorova, V.P., Chakukov, R.F. NATO Science for Peace and Security Series A: Chemistry and Biologythis link is disabled, 2020, pp. 247–258. 11. A Single-Molecule Label-Free Identification of Single-Nucleotide Colorectal-Cancer-DNA Polymorphism Using Impedance Spectroscopy of Self-Redox-Active Decorated Carbon Nanotubes Egorova, V.P., Grushevskaya, H.V., Babenka, A.S., Lipnevich, I.V., Vaskovtsev, E.V. Semiconductorsthis, 2020, 54(14), pp. 1873–1876. 12. Chowdhury AD, Takemura K, Li TC, Suzuki T, Park EY. Electrical pulse-induced electrochemical biosensor for hepatitis E virus detection. Nat Commun. 2019 Aug 19;10(1):3737. 13. Ngamdee T, Yin LS, Vongpunsawad S, Poo-vorawan Y, Surareungchai W, Lertanantawong B. Target Induced-DNA strand displacement reaction using gold nanoparticle labeling for hepatitis E virus detection. Anal Chim Acta. 2020 Oct 16;1134:10-17